annbeaker (annbeaker) wrote,
annbeaker
annbeaker

спрашивают - отвечаем

В коментариях меня спросили, реально ли сделать анализ ДНК   с точностью в 99.9% за 24 часа?

Отвечаю.

Теоретически  возможно сделать анализ ДНК за 24 часа, с точностью в 99.9% - нет.

Практически  все зависит от многих факторов.

1. Какой метод был использован.
2. Наличие контрольного образца, с чем сравнивать. 
3. Наличие технологической базы: сиквенатора, PCR-машины например, той же центрифуги и водяной  бани, чтобы провести ту же элементарную реакцию реассоциации,  спектрофотометра, холодильника на -20, электрофоретических аппаратов, и так далее.

Если предположить, что у бравых американских десантников все это было с собой + нотариус,   и они взяли кровь у подозрительного бородача прямо из вены, тут же на месте, или образец спермы, ну просто выдрали ему клок волос, вырезали кусок кожи.

Будем думать про кровь.
И открутили ее в гардиенте плотности (например, фикола или перкола), ту же собрали интерфазу с моноцитами (самый лучший источник ДНК).   Это по времени  от 20 минут до 1 часа. Ну представим, что центрифуга была в вертолете.

Выделили ДНК - примерно  1 час. Опять же, не отходя от кассы, прямо на поле боя.

Хотя вполне возможно, что на вертолете они вернулись на базу с трупом. Как далеко база от места где был убит персонаж? Мы не занаем.  Но мы знаем, что вертолеты летают с конечной скоростью.

Высушили в вакуумной установке - от 2- до 5 часов (раньше это занимало). Можно опустить.
Быстро порезали ее на куски специальными ферментами ( в обычных лабораториях, резание ферментами геномных ДНК занимает целую ночь (12 часов), а лучше сутки (24 часа), ну может у них суперферменты я не знаю, я выделяла из хвостиков недельных мышат).  
Потом они достали из широких штанин свою зарание заготовленную контрольную ДНК взятую давно от самого Усамки или сперму взятую от его папашки. И тут же провели реакцию реассоциации и померяли на спектрофотометре (который тоже привезли с собой надо полагать) - 1-2 часа.

То вполне можно уложиться в одни сутки, не спать не есть.  Но это самая примитивная метода и не дает конечно 99.9% точности. Максимум 50/50.

Другие методы занимают еще больше времени.

Самое забавное, что Усамка человек известный и не один год. Мне трудно поверить, что у того же ЦРУ нет образцов отпечатков пальцев этого персонажа. Самый элементарный способ опознать труп.  Надеюсь, что хоть кисти рук ему отрубили?

Краткое описание стандартных методов ДНК анализа.
Смотри под кат. 

Restriction Fragment Length Polymorphism (RFLP)
RFLP is a technique for analyzing the variable lengths of DNA fragments that result from digesting a DNA sample with a special kind of enzyme. This enzyme, a restriction endonuclease, cuts DNA at a specific sequence pattern know as a restriction endonuclease recognition site. The presence or absence of certain recognition sites in a DNA sample generates variable lengths of DNA fragments, which are separated using gel electrophoresis. They are then hybridized with DNA probes that bind to a complementary DNA sequence in the sample.

RFLP was one of the first applications of DNA analysis to forensic investigation. With the development of newer, more efficient DNA-analysis techniques, RFLP is not used as much as it once was because it requires relatively large amounts of DNA. In addition, samples degraded by environmental factors, such as dirt or mold, do not work well with RFLP.

PCR Analysis
Polymerase chain reaction (PCR) is used to make millions of exact copies of DNA from a biological sample. DNA amplification with PCR allows DNA analysis on biological samples as small as a few skin cells. With RFLP, DNA samples would have to be about the size of a quarter. The ability of PCR to amplify such tiny quantities of DNA enables even highly degraded samples to be analyzed. Great care, however, must be taken to prevent contamination with other biological materials during the identifying, collecting, and preserving of a sample.

STR Analysis
Short tandem repeat (STR) technology is used to evaluate specific regions (loci) within nuclear DNA. Variability in STR regions can be used to distinguish one DNA profile from another. The Federal Bureau of Investigation (FBI) uses a standard set of 13 specific STR regions for CODIS. CODIS is a software program that operates local, state, and national databases of DNA profiles from convicted offenders, unsolved crime scene evidence, and missing persons. The odds that two individuals will have the same 13-loci DNA profile is about one in a billion.

Mitochondrial DNA Analysis
Mitochondrial DNA analysis (mtDNA) can be used to examine the DNA from samples that cannot be analyzed by RFLP or STR. Nuclear DNA must be extracted from samples for use in RFLP, PCR, and STR; however, mtDNA analysis uses DNA extracted from another cellular organelle called a mitochondrion. While older biological samples that lack nucleated cellular material, such as hair, bones, and teeth, cannot be analyzed with STR and RFLP, they can be analyzed with mtDNA. In the investigation of cases that have gone unsolved for many years, mtDNA is extremely valuable.

All mothers have the same mitochondrial DNA as their offspring. This is because the mitochondria of each new embryo comes from the mother's egg cell. The father's sperm contributes only nuclear DNA. Comparing the mtDNA profile of unidentified remains with the profile of a potential maternal relative can be an important technique in missing-person investigations.

Y-Chromosome Analysis
The Y chromosome is passed directly from father to son, so analysis of genetic markers on the Y chromosome is especially useful for tracing relationships among males or for analyzing biological evidence involving multiple male contributors.

 


Tags: обратная связь
Subscribe

  • трупы плыли по Оке неделю (с)

    Как известно Сталин расстрелял 100500 миллионов лично. Тридцать лет назад я училась с комсомольцами, которые были пионерами и октябрятами. Все…

  • ...

  • ...

  • Post a new comment

    Error

    default userpic

    Your reply will be screened

    Your IP address will be recorded 

    When you submit the form an invisible reCAPTCHA check will be performed.
    You must follow the Privacy Policy and Google Terms of use.
  • 6 comments